Huminstoffe sind Abbauprodukte abgestorbener Biomasse. Sie sind Teil des Humus, welcher die gesamte organische, sich zersetzende Substanz des Bodens darstellt. Huminstoffe stellen dabei als Bestandteil dieses Bodens verschiedene komplexe Makro-Moleküle dar. In der freien Natur spielen Huminstoffe eine sehr wichtige Rolle, um lebensfeindliche Bedingungen für aquatische Lebewesen überhaupt nutzbar zu machen. Erst durch die Nutzung der Huminstoffe sind die Lebewesen in solchen Gewässern in der Lage, genügend lebenswichtige Mineralien anzusammeln, wie zum Beispiel Calcium für den Knochenaufbau. Daher sind Huminstoffe bei der Pflege von Tieren, die aus solchen Schwarzwasserhabitaten stammen, im Aquarium sogar überlebenswichtig, da sie sich sehr stark an die Anwesenheit und Nutzung angepasst haben.

Gerbstoffe im Wasser sind eine Ursache für braunes oder gelbes Wasser. Die bekanntesten Gerbstoffe sind Tannine und Flavonoide. Im Aquarium machen sie das Wasser saurer und hemmen dadurch unter anderem Krankheitserreger. Gerbsäuren sind natürliche Inhaltsstoffe von verschiedenen Pflanzen wie Erlen, Eichen, Buchen, Seemandelbäumen, Zimt und so weiter. Es handelt sich hier um aromatische Verbindungen, die Phenolgruppen enthalten. Genauso wie Huminstoffe, machen sie das Wasser keimfreier, durch ihre antibakterielle und fungizide Wirkung. Sie verleihen dem Wasser ebenfalls einen bernsteinfarbenen Ton und sorgen für einen entsprechenden osmotischen Wert. Huminstoffe haben allerdings neben der leicht färbenden und ansäuernden Wirkung noch viele andere positive Eigenschaften, die den Gerbstoffen fehlen. Es kann also unter Umständen nicht ausreichen, ein paar Erlenzapfen ins Aquarium einzubringen. 

Ein Biotop ist ein räumlich begrenzter Lebensraum, bestimmter Pflanzen, Tiere und Organismen. Das Biotop ist geprägt durch unterschiedlichste Umweltfaktoren. Dazu zählen zum Beispiel Wind, Wärme, Licht, der Bodenuntergrund oder das Wasservorkommen. Sie prägen den jeweiligen Standort und schaffen die Vorraussetzungen für das Leben der verschiedenen Pflanzen und Tierarten. Einige Arten findet man in mehreren Biotopen an. Manche Arten sind aber auch endemisch vertreten. Das bedeutet das man sie ausschließlich in diesem einen Biotop antrifft.